Comparación genetica de tres fuentes del cacao theobroma cacao l., mediante el uso de marcadores microsatelites

  • Ximena Ruiz Erazo Universidad Nacional de Colombia
  • Martha Almanza Pinzon Universidad del Cauca
  • Yacenia Morillo Coronado Universidad de los Llanos
  • Ana Cruz Morillo Coronado Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia
  • Alvaro Caicedo Arana CORPOICA
  • Alonso Gonzalez Corpoica
Palabras clave: Diversidad genética, Marcadores moleculares, Germoplasma.

Resumen

Las poblaciones nativas de cacao Theobroma cacao L., son valoradas en mercados internacionales por sus características organolépticas propias de los cacaos de alta calidad. Sin embargo, esta calidad está amenazada por híbridos más productivos provenientes de material genético foráneo que gradualmente han ido reemplazando las poblaciones nativas. La diversidad y estructura genética de 165 materiales de cacao provenientes de la región de Tumaco y los bancos de germoplasma de Corpoica y Fedecacao fue evaluada mediante el análisis de doce loci ubicados por marcadores microsatélites. Los datos se procesaron mediante los programas: Arlequín ver. 3.5 y TFPGA ver. 1.3. Los marcadores fueron altamente discriminantes, informativos y representativos para la especie. Los promedios de heterocigosidad esperada (He) y observada (Ho) fueron 0,73 y 0,72, respectivamente, indicando alta variabilidad genética y alta tasa de heterocigotos en las tres poblaciones analizadas. El valor del índice de fijación FST= 0,0355 señala mínimos niveles de diferenciación genética entre las poblaciones y el promedio Nm = 6,80 indica que existe un elevado intercambio de genes. El análisis del clúster jerárquico utilizando agrupamiento UPGMA permitió confirmar la similitud genética existente entre las poblaciones.

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Biografía del autor/a

Ximena Ruiz Erazo, Universidad Nacional de Colombia
Grupo de investigación en Diversidad Biológica. Magister en Ciencias Agrarias.
Martha Almanza Pinzon, Universidad del Cauca
Doctorado en Ciencias Agropecuarias
Yacenia Morillo Coronado, Universidad de los Llanos
Doctorado en Ciencias Agropecuarias
Ana Cruz Morillo Coronado, Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia

Doctorado en Ciencias Agropecuarias Tunja, Boyacá.

Alvaro Caicedo Arana, CORPOICA
Investigador. Master Universitario en Citricultura
Alonso Gonzalez, Corpoica

Director de Investigación y transferencia Tecnológica. Doctorado en Fisiología de plantas. Cundinamarca, Colombia

Referencias bibliográficas

REFERENCIAS

ORGANIZACIÓN DE LAS NACIONES UNIDAS (ONU). Convenio de Diversidad Biológica. Programa de las Naciones Unidas para el medio ambiente [en linea]. 1992. Programa de las Naciones Unidas para el medio ambiente (PNUMA). Disponible: http://www.cbd.int/doc/legal/cbd-es.pdf. [citado 16 de Febrero de 2014].

LANTERI, S. and BARCACCIA, G. 2006. Molecular marker based analysis for crop germoplasm preservation. The role of biotechnology, 2005, p. 55-66.

CUATRECASAS, J. A taxonomic revision of the genus Theobroma. Contr. Natl. Herb. 35(6), 1964, p. 379-607.

CHEESMAN, E. Notes on the nomenclature, classification and possible relationships of cocoa populations. Journal of Tropical Agriculture, 21, 1944, p. 144–159.

CERVANTES, C., BROWN, J. and SCHNELL, R. Combining ability for disease resistance, yield, and horticultural traits of cacao Theobroma cacao L. clones. Journal of the American Society for Horticultural Science, 131(2), 2006, p. 231-241.

EFOMBAGN, M., NYASSÉ, S., SOUNIGO, O., KOLESNIKOVA, M. and ESKES, A. Participatory cocoa Theobroma cacao selection in Cameroon: Phytophthora pod rot resistant accessions identified in farmers’ fields. Crop Protection, 26, 2007, p. 1467-1473.

LANAUD, C., FOUET, O., CLÉMENT, D., BOCCARA, M., RISTERUCCI, A., SURUJDEO, S., LEGAVRE, T. and ARGOUT, X. A meta-QTL analysis of disease resistance traits of Theobroma cacao L. Molecular Breeding, 24, 2009, p. 361-374.

VAZQUEZ, A., MOLINA, F., FARFÁN, J. y SALVADOR, M. Potencial de los marcadores moleculares para el rescate de individuos de Theobroma cacao L., de alta calidad. BioTecnología, 16(1), 2012, p. 36–56.

DOYLE, J. and DOYLE, J. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, 12, 1990, p. 13–15.

LANAUD, C., RISTERUCCI, A., PIERETTI, I., FALQUE, M., BOUET, A. and LAGODA, P. Isolation and characterization of microsatellites in Theobroma cacao L. Molecular Ecology, 8, 1999, p. 2141-2152.

EXCOFFIER, L., LAVAL, G. and SCHNEIDER, S. Arlequin ver. 3.0: An integrated software package for population genetics data analysis. Evolutionary Bioinformatics [online]. 2005. Disponible: http://www.la-press.com/journal-evolutionary-bioinformatics-j17. [citado 6 de Marzo de 2014].

PEAKALL, R. and SMOUSE, P. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics, 28, 2012, p. 2537-2539.

WRIGHT, S. The genetical structure of populations. Annals of Eugenics, 15, 1951, p. 323-354

SNEATH, P. and SOKAL, R. Numerical taxonomy. The principles and practice of numerical classification. San Francisco (USA): W.H. Freeman and Co, 1 ed., 1973, 588 p.

NEI, M. Genetic distance between populations. The American Naturalist, 106(949), 1972, p. 283-292.

MILLER, M. Tools for population genetic analyses (TFPGA) 1.3: A Windows program for the analysis of allozyme and molecular population genetic data. Arizona (USA): Northern Arizona University, Department of Biological Sciences, 1997, 30 p.

OSORIO, J. Caracterización molecular del banco de germoplasma de cacao (Theobroma cacao, L) del Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas SINCHI mediante marcadores moleculares tipo microsatélites [Tesis Biólogo]. Bogotá (Colombia): Pontificia Universidad Javeriana, Facultad de Ciencias, 2009, p. 12-47.

LOOR, R., RISTERUCCI, A., COURTOIS, B., FOUET, O., JEANNEASU, M., ROSENQUIST, E., AMORES, F., VASCO, A., MEDINA, M. and LANAUD, C. 2009. Tracing the native ancestors of the modern Theobroma cacao L. population in Ecuador. Tree Genetics and Genomes, 5, p. 421-433.

CRYER, N., FENN, M., TUMBULL, C. and WILKINSON, M. 2006. Allelic size standars and reference genotypes to unify international cocoa Theobroma cacao L microsatellite data. Genetic Resources y Crop Evolution, 53, 2006, p. 1643-1652.

LONDOÑO, J., GIL, D., AGUILAR, S., RIVERA, F. y LÓPEZ, G. Caracterización molecular de clones de Theobroma cacao L., por medio de marcadores moleculares microsatélites. Revista Luna Azul, 32, 2011, p. 52-60.

SCHELTEMA, T. La autoincompatibilidad en los híbridos de cacao del CATIE. San José (Costa Rica): CATIE. 2 -7, Documento de trabajo no 47, 1989, 100 p.

IRISH, B., GOENAGA, R., ZHANG, D., SCHNELL, R., BROWN, S. and MOTAMAYOR, J. 2010. Microsatellite Fingerprinting of the USDA-ARS Tropical Agriculture Research Station Cacao Theobroma cacao L. Germplasm Collection. Crop Science, 50, 2010, p. 656-665

SÁNCHEZ, I., ZÁRATE, L., GALLEGO, G. y TOHME, J. 2007. Análisis de la diversidad genética de accesiones de Theobroma cacao L. del banco de conservación a cargo de CORPOICA. Revista CORPOICA – Ciencia y Tecnología Agropecuaria, 8(2), p. 26-31.

SERENO, M., ALBUQUERQUE, P., VENCOVSKY, R. and FIGUEIRA, A. Genetic diversity and natural population structure of cacao Theobroma cacao L., from the Brazilian Amazon evaluated by microsatellite markers. Conservation Genetics, 7, 2006, p. 13–24.

ZHANG, D., BOCCARA, M., MOTILAL, L., BUTLER, D., UMAHARAN, P., MISCHKE, S. and MEINHARDT, L. Microsatellite variation and population structure in the ‘Refractario’ cacao of Ecuador. Conservation Genetics, 9, 2008, p. 327-337.

RORER, J. Ecuador cacao (part 2). Tropical Agriculture Trinidad, 3, 1926, p. 68-69.

REATEGUI, E., RENNO, J., CARVAJAL, F., CORVERA, R., DEL CASTILLO, D. y GARCÍA C. 2009. Evaluación de la variabilidad genética de la castaña Bertholletia excelsa en la región de madre de dios mediante marcadores microsatélites. Folia amazónica, 18(1-2), 2009, p. 41–50.

ZHANG, D., MISCHKE, S., JOHNSON, E., PHILLIPS-MORA, W. y MEINHARDT, L. Molecular characterization of an international cacao collection using microsatellite markers. Tree Genetics & Genomes, 5, 2009, p. 1-10.

ZHANG, D., BOCCARA, M., NOTLLAIL, L., BUTLER, D., UMAHORAN, P., MISHK, S. and LYNDEL, M. 2007. Microsatellite variation and population structure in the Refractario Cacao of Ecuador. Conservation Genetics, 9, 2007, p. 327–327.

ROMERO, C., BONILLA, J., SANTOS, E. y PERALTA, E. Identificación varietal de 41 plantas seleccionadas de cacao Theobroma cacao L., provenientes de cuatro cultivares distintos de la región amazónica ecuatoriana mediante el uso de marcadores microsatélites. Revista tecnológica ESPOL, 23(1), 2010, p. 121-128.

Cómo citar
Ruiz Erazo, X., Pinzon, M. A., Morillo Coronado, Y., Morillo Coronado, A. C., Caicedo Arana, A., & Gonzalez, A. (2015). Comparación genetica de tres fuentes del cacao theobroma cacao l., mediante el uso de marcadores microsatelites. Biotecnología En El Sector Agropecuario Y Agroindustrial, 13(1), 10–18. Recuperado a partir de https://revistas.unicauca.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/365
Publicado
2015-07-01
Sección
Artículos de Investigaciòn
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