Análisis de la diversidad genética de la mora (rubus spp.) en el departamento de boyacá
Resumen
Una muestra de 21 ecotipos genéticos de Rubus spp, se caracterizaron mediante marcadores Microsatélites Aleatorios RAMs. Los siete cebadores produjeron un total de 160 bandas polimórficas con pesos moleculares entre 350 y 1500 Kb. El análisis RAMs a un nivel de similitud del 55% diferenció a la población en cinco grupos en forma general de acuerdo con el sitio donde fueron colectados dichos ecotipos. El número de loci polimórficos varió de 16 (ACA) a 27 (CGA). Para la población total el porcentaje de loci polimórficos y la heterocigosidad promedio esperada (He) fueron de 88% y 0,29, respectivamente, más bajo que los encontrados en otros estudios de diversidad genética en el género Rubus; por lo tanto, se deben buscar estrategias para incrementar la variabilidad genética. El coeficiente de diferenciación genética (Fst) obtenido al evaluar los ecotipos de Rubus, con los siete marcadores microsatélites RAMs fue de 0,29 con una desviación estándar de 0,03, valores que muestran una alta diferenciación genética, la cual está asociada con el nivel de estructuración de la población que tiende a estabilizarse.
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Referencias bibliográficas
1 ASOHOFRUCOL, FONDO NACIONAL DE FOMENTO HORTOFRUTÍCOLA, DEPARTAMENTO ADMINISTRATIVO NACIONAL DE ESTADÍSTICA (DANE), SISAC, MINISTERIO DE AGRICULTURA Y DESARROLLO RURAL. I Censo Nacional de 10 frutas agroindustriales y promisorias. Bogotá (Colombia): 2014, 63 p.
2 CÁRDENAS, Y. Evaluación agronómica y fenología de dos clones de mora sin espinas (Rubus glaucus Benth) para determinar su potencial comercial Tesis Ingeniería Agronómica. Quito (Ecuador): Universidad Central de Ecuador, 2014, 120 p.
3 MORILLO, A., MORILLO, Y., MUÑOZ, J., VÁSQUEZ., H. y ZAMORANO, A. Caracterización molecular con microsatélites aleatorios RAMs de la colección de mora, Rubus spp, de la Universidad Nacional de Colombia, Sede Palmira. Acta Agronómica, 54(2), 2005, p. 15-14.
4 MARULANDA, M., LÓPEZ, A. and URIBE, L. Molecular characterization of the Andean blackberry, Rubus glaucus, using SSR markers. Genetic and Molecular Research, 11(1), 2012, p. 322-331.
5 CANCINO, G., BARBOSA, D. y DÍAZ, C. Diversidad genética de especies silvestres y cultivadas de Rubus L. de los municipios de Pamplona y Chitagá, región Nororiental de Colombia. Revista Bistua, 10(1), 2012, p. 80-89.
6 SEDIGHI, E. and RAHIMMALEK. Evaluation of genetic diversity of Rubus hyrcanus using Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) and morphological markers. Biología, 70(3), 2015, p. 339-348.
7 WARD, J., BHANGOO, J., FERNÁNDEZ, F., MOORE, P., SWANSON, J.D., VIOLA, R., VELASCO, R., BASSIL, N., WEBER, C. and SARGENT, D. Satured linkage map construction in Rubus ideaeus using genotyping by sequencing and genome-independent imputation. BMC Genomics, 14(2), 2013, p. 1-14.
8 LONGHI, S., GIONGO, L., BUTI, M., SURBANOVSKI, N., VELASCO, R., WARD, J. and SARGENT, D. Molecular genetics and genomics of the Rosoideae: state of the art and future perspectives. Horticultural Research, 1(1), 2014, p. 1-18.
9 KOSTAMO, K., TOLIJAMO, A., ANTONIUS, K., KOKKO, H. and KÄRENLAMPI, S. Morphological and molecular identification to secure cultivar maintenance and management of self-sterile Rubus articus. Annals of Botany, 11(4), 2014, p. 713-721.
10 MARULANDA, M. and LÓPEZ, A. Characterization of thornless Rubus glaucus in Colombia. Canadian Journal Pure Applied Science, 3(3), 2009, p. 875-885.
11 MORILLO, A., MORILLO, Y. y PINZÓN, E. Caracterización con RAMs de la colección de durazno (Prunus pérsica (L.) Batsch existente en la Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia. Acta Agronómica, 63(4), 2014, p. 367-376.
12 MORA, S., MORILLO, Y., MORILLO, A., CAICEDO, A. y MUÑOZ, J. Caracterización molecular con Microsatélites aleatorios RAMs de 30 accesiones de mandarina (Citrus reticulata) del Banco de Germoplasma de Corpoica-Palmira. Investigación Agropecuaria, 10(2), 2013, p. 161-172.
13 NEI, M. and LI, W. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonuclease. Proceedings of the National Academy of Sciences, 79(10), 1979, p. 5267-5273.
14 MARTÍNEZ, M. Caracterización molecular de genotipos de mandarinas Citrus spp. Mediante marcadores RAMs (Microsatélites Amplificados al Azar) y microsatélites Tesis de Maestría en Ciencias Biológicas, Biotecnología Vegetal Palmira (Colombia): Universidad Nacional de Colombia, 2013, 141 p.
15 MORILLO, Y., MORILLO, A., MUÑOZ, J., BALLESTEROS, W. and GONZÁLEZ, A. Molecular characterization of 93 genotypes of cocoa (Theobroma cacao L.) with random amplified microsatellites RAMs. Agronomía Colombiana, 32(3), 2014, p. 315-325.
16 WRIGHT, S. Evolution and the genetics of populations, variability within and among natural populations. Chicago (USA): University of Chicago Press, 1978, 566 p.
17 SOMAYEH, A., IRAJ, M., ALIREZA, T. and TAHER, N. Intra-specific variations of Rubus sp. (Rosaceae) in Northern Iran: morphometric analysis and microsatellite markers. Journal of Biodiversity and Environmental Sciences, 5(1), 2014, p. 189-198.
18 LEE, G., SONG, J., CHOI, H., CHUNG, J., JEON, Y., LEE, J., MA, K. and LEE, M. Novel Microsatellite Markers Acquired from Rubus coreanus Miq. And Cross-Amplification in other Rubus species. Molecules, 20(4), 2015, p. 6432-6442.
19 MARMOLEJO, D. Evaluación de apomixis en germoplasma seleccionado de mora de castilla Rubus glaucus Benth Tesis de Maestría en Ciencias Agrarias, énfasis en Fitomejoramiento. Palmira (Colombia): Universidad Nacional de Colombia, 2010, 41 p.
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